台灣公立疫苗製造歷史最早可回溯至日治時代，由當時台灣總督府研究所，開始進行血清疫苗研究及生產台灣本島所需疫苗，日治後期及戰後相關疫苗研發製造業務，改由當時熱帶醫學研究所士林支所承接。血清疫苗製造所時期，我國接受國際援助，開啟多種國產生物製劑製造，尤其後來國產乾燥痘苗更被國際讚譽為當時最佳品質疫苗；爾後台灣自製霍亂疫苗、白喉抗毒素及痘苗等疫苗更協助支援國際防疫，寫下國產疫苗史上國際合作光輝的一頁。近期為了提升疫苗原料品質興建國家免疫馬匹畜牧場，更規劃將官方疫苗生產技術逐步技轉給民間廠商，與財團法人國家衛生研究院合作，建立疫苗先導工廠及與其簽訂生物製劑委託製造合作計畫，公立疫苗生產在此畫下完美句點。
