為了解救在與人造人展開激戰之後喪命的哥哥‧愛德華，弟弟‧阿爾馮斯嘗試進行人體鍊成。但是鍊成的代價就是他連盔甲身體都失去了。復活之後的愛德，為了讓阿爾復活，也再次進行了人體鍊成，而他鍊成阿爾之生命的代價，就是被送到門的另一端的「現實世界」去。而時間就這樣過了三年…在德國的慕尼黑生活的愛德華與「鍊金術世界」的阿爾馮斯…當兩人的世界交叉時，被敲響的真實會是什麼？大受好評的電視動畫「鋼之鍊金術師」的完結篇…電影版將以彩色漫畫的方式登場！
